LABORATUVARLAR

BİTKİ MOLEKÜLER BİYOLOJİSİ LABORATUVARI

---

ARAŞTIRMA ALANLARI 

• Toksik metaller ve petrol hidrokarbonlarıyla kirlenmiş karasal ve sulak alanlar için biyoremediasyon teknolojilerinin geliştirilmesi
• Bakteri, alg ve bitkilerin bioremediasyon kapsitesinde işlevi olan genlerin tanımlanması ve fonksiyonel karakterizasyonu
• Islah programlarında kullanılabilecek markörlerin tespit edilmesi
• Stres koşullarında farklı anlatım yapan genlerin transkriptomik ve proteomik karakterizasyonu
• Agronomik değeri yükseltilmek amacıyla genetiği değiştirilmiş organizmaların geliştirilmesi

MAM GMBE Bitki Moleküler Biyolojisi Laboratuvarı (BML) üniversite, devlet kurumları ve özel sektörle yapılan geniş tabanlı Ar-Ge projeleri kapsamında abiyotik stres mekanizmaları, biyoremediasyon teknolojileri ve genetiği değiştirilmiş organizmaların geliştirilmesi konularında çalışmalarını sürdürmektedir. Bu çalışmalar kapsamında transkriptomik, proteomik ve biyoinformatik yöntemleri ve bitkilere gen aktarımı gibi ileri moleküler biyoloji teknikleri rutin olarak kullanılmaktadır.
Abiyotik stres etmenleri ile ilgili yapılan çalışmalar kapsamında, farklı bitkilerin sıcaklık, kuraklık gibi çevresel etmenler ile ağır metal ve petrol hidrokarbon kirliliği gibi toksik etmenlere karşı verdiği farklı fenotipik tepkiler değerlendirilmekte ve bunların transkriptomik analizleri yapılmaktadır. Türkiye’deki önemli zirai bitkilerin yabani akrabalarında var olan biyoçeşitliliğin kullanımıyla tarımsal verimin attırılması hedeflenmektedir. Bu amaçla başta QTL analizi olmak üzere farklı yaklaşımlarla yeni kaynakların bulunmasına yönelik çalışmaların gerçekleştirilmesi planlanmaktadır.

BML’nin bir diğer araştırma alanı, bazı bitkilerin biyoremediasyon kapasitelerinin daha iyi olmasına neden olan genleri açığa çıkararak ve fonksiyonel karakterizasyonlarını yaparak, bu bitkilerin ağır metaller (örneğin, Zn, Cu ve Cd) ve petrol hidrokarbonlarıyla kirlenmiş çevrelerin temizlenmesinde kullanılabilir duruma getirilmesidir. Dolayısıyla BML, kirlenmiş toprakların tarıma elverişli duruma getirilmesi için yeni bioremediasyon stratejileri geliştirmeyi hedeflemektedir.

YÜRÜTÜLEN PROJELER

Böceklere Dayanıklı Transgenik Mısır Bitkilerinin Geliştirilmesi

Program: TÜBİTAK 1001 - Akademik AR-GE Destekleri Programı
Destekleyen Kuruluş: TÜBİTAK  Araştırma Destek Programları Başkanlığı (ARDEB)
Proje Süresi: 2010-2013

Microarray Analysis and Functional Characterization of Drought Stress Related Genes in Wheat

Destekleyen Kuruluş: International Center for Genetic Engineering and Biotechnology ( ICGEB)
Proje Süresi: 2010-2013

TAMAMLANAN PROJELER

Bitki, Alg ve Mikroorganizmalar Kullanılarak, Hidrokarbonlarla Kirlenmiş Alanları İyileştirilmesinin Araştırılması

Program: TÜBİTAK 1007 - Kamu Kurumları AR-GE Projelerini Destekleme Programı
Destekleyen Kuruluş: Tarım ve Köy işleri Bakanlığı Tarımsal Araştırmalar Genel Müdürlüğü (TAGEM)
Proje Süresi: 2006-2010

Sürdürülebilir Toprak Kullanımı ve Gıda Güvenliğini Artırmak İçin Fitoteknolojiler

Program: AB COST Programı
Destekleyen Kuruluş: TÜBİTAK Uluslararası İşbirliği Dairesi Başkanlığı
Proje Süresi: 2005-2010

YAYINLAR

• Cevher Keskin, B., Topal Sarıkaya A., Yüksel B., Abscisic Acid Regulated Gene Expression in Bread, Australian Journal of Crop Science, 4 8 617-625 11 2010

• Erol, C., Ertekin, Ö., Yıldızhan, Y. Onarıcı, S. The Effect of Siberian Light Crude Oil on Alfalfa, Asian Journal Of Chemistry, 23 2 593-596 11 2010

• Troxell, H., Salandanan, K., Kendal, P., Bunning, M., Stonaker, F., Külen, O., Stushnoff, C. Cultivater Choice Provides Options for Local Production of Organic and Conventionally Produced Tomatoes with Higher Quality and Antioxidant Content, Journal of Science of Food and Agriculture, 90 15 2548-2555 12 2010

• Yüksel B. and A.R. Memon (2009). Legume small GTPases and their role in the establishment of symbiotic associations with Rhizobium spp. Plant Signaling and Behavior 4(4)

• Gulbitti Onarici, S., C. Sancak, C.S. Sevimay, H. Ekiz, S. Ozcan (2009). “Genetic Relationships Among Medicago satîva L. Clones Commonly Grown In Central Anatolia”, Tarım Bilimleri Dergisi 15:2 142-147

• Gulbitti-Onarici, S., C. Sancak, S. Ozcan, S. Sumer (2009). Phylogenetic relationships of some wild wheat species based on the internal transcribed spacer (ITS) sequences of nrDNA. Current Science. 96(6) 794-800

• Gülbitti-Onarici, S., M.Z. Zaidi, I.Taga, S. Ozcan, I. Altosaar (2009). Expression of Cry1Ac in transgenic tobacco plant under the  control of a wound-induced promoter (AoPR1) isolated from Asparagus officinalis to control Heliothis virescens and Manduca sexta. Molecular Biotechnology  42.341–349

• Yüksel B. and A.R. Memon (2008). Comparative phylogenetic analysis of small GTP-binding genes of model legume plants and assessment of their roles in root nodules. Journal of Experimental Botany 59(14) 3831-3844

• Gulbitti-Onarici, S., S. Sumer, S. Ozcan (2007). Phylogenetic relationships among some wild wheat species revealed by AFLP markers, Botanical Journal of the Linnean Society 153 , 67–72

• Bayazit S., K. Kazan, S. Gulbitti-Onarici, V. Cevik, H. Ayanoğlu, A. Ergül (2007). AFLP analysis of genetic diversity in low chill requiring walnut (Juglans regia L.) genotypes from Hatay, Turkey, Scientia Horticulturae,  111( 4) , 394-398

• Memon A.R., Keskin, B.C. (2006) Signal Transduction in Plants, Plant Biotechnology, Editors: S. Özcan, E. Gürel, M. Babaoğlu ISBN: 975-6652

• Yüksel B. and A. H. Paterson (2005) Construction and Characterization of a Peanut BAC library.  Theoretical and Applied Genetics 111(4):630-639

• B. Yüksel, J. C. Estill, S. R. Schulze and A. H. Paterson (2005) Evolutionary, Genetic, and Physical Analysis of Peanut Resistance Gene-Like sequences. Molecular Genomics and Genetics 274(3) 248-263. (D01 10.1007/5000438-005-022-7)

• B. Yüksel, J. E. Bowers, J. C.  Estill, L. Goff, C. Lemke, and A. H. Paterson (2005). Exploratory integration of peanut genetic and physical maps and possible contributions from Arabidopsis “Theoretical and Applied Genetics” 111(1):87-94

EĞİTİMLER

-Bitki Moleküler Genetiğinde Son Teknikler Uygulamalı Eğitimi  (02-06 Mayıs 2011)

-Temel Biyoinformatik Yöntemler Uygulamalı Eğitimi  (30 Mayıs - 03 Haziran 2011)

Güncelleme Tarihi : 05.04.2011